Uma vez que o polímero do antígeno O esteja conectado com o núcleo do lipídio A, ele interromperá a reação de polimerização. Ou seja, a reação de conexão pode terminar a reação de polimerização. Tanto o núcleo do lipídio A quanto o lipopolissacarídeo com diferentes unidades de repetição de comprimento podem ser efetivamente transferidos para a membrana externa. Portanto, o tamanho molecular do lipopolissacarídeo pode ser visto por SDS-PAGE, que é causado pela diferença no sistema de biossíntese e não pelo fator do sistema de saída.

A distribuição da cadeia lateral do antígeno O em diferentes bactérias é diferente, algumas das quais contêm cerca de 20 unidades repetidas e outras podem ter cerca de 100 unidades repetidas. Na eletroforese SDS-PAGE, a diferença na intensidade de coloração de prata de diferentes moléculas de diferentes espécies de bactérias é refletida. A razão para a distribuição diferente do comprimento da cadeia lateral do antígeno O em diferentes bactérias pode ser que haja um fator de seleção de tamanho no processo de policondensação do antígeno O ou reação de conexão. Wzz (isto é, Rol ou Cld) é uma proteína importante que regula a distribuição do comprimento da cadeia lateral em bactérias que sintetizam antígenos via via dependente de Wzy, mas seu mecanismo específico ainda não está claro.