As diferentes composições de endotoxina podem levar a três formas de fenótipo bacteriano, ou seja, tipo liso, tipo áspero e tipo intermediário (também chamado de tipo de muco). Quando o componente central do polissacarídeo é reduzido ou danificado, a aparência das colônias de cultura bacteriana é irregular, por isso é chamado de mutante rugoso (rough-LPS, R), que pode ser chamado de Rb-LPS, Rc-LPS, Rd-LPS, Re -LPS de acordo com o grau do defeito do polissacarídeo central, conforme mostrado na figura .
O microscópio eletrônico de Escherichia coli LPS com colônias lisas é uma estrutura delgada semelhante a um cordão, enquanto o tipo áspero de Escherichia coli LPS é principalmente uma estrutura circular. Devido aos diferentes comprimentos de sua cadeia de açúcar, serão produzidos diferentes efeitos de impedimento estérico, que afetarão o reconhecimento e a fagocitose de LPS e CNB pelas células imunes do corpo, de modo que o hospedeiro terá diferentes efeitos imunológicos sobre ele e afetará o eliminação de bactérias pelo organismo.
A cadeia de açúcar do tipo áspero é curta e é fácil de ser engolida por fagócitos, como fagócitos ocupacionais: neutrófilos e macrófagos, que são fáceis de remover bactérias do tipo áspero; A cadeia de açúcar lisa é longa, tem impedimento estérico, não é fácil de ser engolida pelos fagócitos e combinada com o complemento, e é fácil escapar da resposta imune do corpo a ela.